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Processar

process_sisma_export()
Processar: Dados em formato .csv do SISMA
process_disa_cv()
Processar: Carga Viral (CV) da DISA OpenLDR
process_disa_dpi()
Processar: Diagnóstico precoce infantil (DPI) da DISA OpenLDR
process_pop_ine()
Processar: Projecções demográficas distritais do INE
process_naomi()
Processar: Naomi 'indicators' .csv
process_sisma_csv() superseded
Processar: Dados em formato .csv do SISMA

Arrumar

parse_sisma_csv()
Arrumar dados SISMA por tipo
parse_sisma_ats_auto()
Arrumar: Auto-diagnóstico do HIV
parse_sisma_ats_ccsd()
Arrumar: Testagem do HIV da CCS e CCR
parse_sisma_ats_history()
Arrumar: Testagem do HIV em populações-chave/vulnerável e historial
parse_sisma_ats_index()
Arrumar: Testagem do HIV caso índice
parse_sisma_ats_results()
Arrumar: Testagem do HIV (Registo ATS)
parse_sisma_ats_saaj_cm()
Arrumar: Testagem do HIV SAAJ
parse_sisma_ats_smi()
Arrumar: Testagem do HIV SMI
parse_sisma_bes()
Arrumar: Boletim epidemiológico semanal (BES)
parse_sisma_hiv_ajmhcmm()
Arrumar: Adolescente joven mentor, homem campeão, e mães mentoras
parse_sisma_hiv_apss()
Arrumar: Apoio psicossocial do HIV (APSS)
parse_sisma_hiv_dah()
Arrumar: Doença avançada do HIV
parse_sisma_hiv_its()
Arrumar: Infecções de transmissão sexual (ITS)
parse_sisma_hiv_prep()
Arrumar: Profilaxia Pré-Exposição (PrEP)
parse_sisma_hiv_tarv()
Arrumar: Tratamento Antiretroviral (TARV)
parse_sisma_smi_ccd()
Arrumar: Consulta da criança doente (CCD)
parse_sisma_smi_ccr()
Arrumar: Consulta da criança de risco (CCR)
parse_sisma_smi_ccs()
Arrumar: Consulta da criança sadia (CCS)
parse_sisma_smi_cpn()
Arrumar: Consulta pré-natal (CPN)
parse_sisma_smi_cpp()
Arrumar: Consulta pós-parto (CPP)
parse_sisma_smi_mat()
Arrumar: Maternidade (Mat)
parse_sisma_smi_pav()
Arrumar: Programa alargado de vacinação (PAV)
parse_sisma_smi_pf()
Arrumar: Planeamento familiar (PF)
parse_sisma_smi_pf_int()
Arrumar: Planeamento familiar (PF) integrado
parse_sisma_smi_ug()
Arrumar: Urgência de ginecológica (UG)

Limpar

clean_disa_dpi()
Função auxiliar para recodificar o quadro de dados DISA
clean_sisma_df()
Limpar ficheiro bruto SISMA
clean_sisma_csv() superseded
Importar e limpar ficheiro .csv do SISMA

Utilitários

read_example_csv()
Lê dados de exemplo no ambiente R
id_check_disa()
Detetar casos problemáticos de mapeamento de UID DISA
load_pop_ine()
Importar quadro de dados populacionais INE
recode_ine_age()
Recodificar a idade em faixas etárias de cinco anos
check_exact_match()
Mapear ficheiro de insumo ao modelo de processamento
add_missing_vars()
Adiciona variáveis em falta nos quadros arrumados pelas funções parse
set_language()
Define a lingua dos variáveis no quadro gerado
setup_sismar_folder()
Cria uma estrutura padrão de pastas
seq_vars()
Reordena variáveis em sequência padrão

Metadados

data_disa_uid_map
Mapa de UID para ligação entre DISA, SISMA e DATIM
data_sisma_geo_above_site
Mapa para ligar os códigos de forma da província e do distrito aos dados SISMA
data_sisma_geo_sites
Mapa para ligar as coordenadas geográficas aos dados das unidades de saúde SISMA
data_sisma_sitelist
Lista de unidades sanitárias SISMA
attach_meta_coord()
Anexar: Coordenadas geográficas
attach_meta_mq()
Anexar: Metadados da melhoria da qualidade
attach_meta_partner()
Anexar: Metadados do apoio dos parceiros
attach_meta_pepfar_ip()
Anexar: Metadados do apoio dos parceiros PEPFAR
attach_meta_uid()
Anexar: Metadados uid das provincias e distritos