
Package index
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add_missing_vars()
- Adicionar variáveis faltando no quadro de dados arrumado pela família de funções
parse
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attach_meta_coord()
- Anexar coordenadas geográficas das unidades sanitárias
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attach_meta_mq()
- Retreive and attach MQ metadata
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attach_meta_partner()
- Retreive and attach partner metadata
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attach_meta_pepfar_ip()
- Retreive and attach partner metadata
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attach_meta_uid()
- Retreive and attach province and district uid metadata
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check_exact_match()
- Helper function to check for input matches against template
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clean_disa_dpi()
- Helper function for recoding DISA dataframe
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clean_sisma_csv()
superseded - Clean SISMA .csv exports
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clean_sisma_df()
- Clean SISMA input file prior to parsing
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data_disa_uid_map
- UID map for linking DISA, SISMA and DATIM
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data_sisma_geo_above_site
- Map for linking province and district shape codes to SISMA data
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data_sisma_geo_sites
- Map for linking geocoordinates to SISMA health facility data
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data_sisma_sitelist
- Deduplicated SISMA site list
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dedup_naomi()
- Deduplicate Naomi CSV file
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id_check_disa()
- Detetar casos problemáticos de mapeamento de UID DISA para investigação
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parse_sisma_ats_auto()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de auto-diagnóstico do HIV
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parse_sisma_ats_ccsd()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de testagem do HIV nas consultas da criança sadia (CCS) e em risco (CCR)
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parse_sisma_ats_history()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de testagem do HIV em populações-chave e vulneráveis e dados da historial de testagem do HIV
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parse_sisma_ats_index()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de testagem do HIV caso índice
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parse_sisma_ats_results()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de testagem do HIV reportado a partir do registo ATS
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parse_sisma_ats_saaj_cm()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de testagem do HIV dos Serviços Amigos dos Adolescentes e Jovens (SAAJ)
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parse_sisma_ats_smi()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de testagem do HIV dos Serviços Saúde Materno-Infantil (SMI)
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parse_sisma_csv()
- Arrumar quadros de dados SISMA por tipo especificado pelo utilizador
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parse_sisma_hiv_ajmhcmm()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de Adolescente joven mentor, homem campeão, mães mentoras
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parse_sisma_hiv_apss()
- Arrumar quadros de dados para os serviços Apoio Psicossocial (APSS), do PNC ITS-HIV/SIDA
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parse_sisma_hiv_dah()
- Arrumar quadros de dados para os serviços doença avançada do HIV
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parse_sisma_hiv_its()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de Infecções de Transmissão Sexual (ITS) do PNC ITS-HIV/SIDA
-
parse_sisma_hiv_prep()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de Profilaxia Pré-Exposição (PrEP)
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parse_sisma_hiv_tarv()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de Tratamento Antiretroviral (TARV)
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parse_sisma_smi_ccd()
- Arrumar quadros de dados para os serviços da Consulta da Criança Doente (CCD)
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parse_sisma_smi_ccr()
- Arrumar quadros de dados para os serviços da Consulta da Criança de Risco (CCR)
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parse_sisma_smi_ccs()
- Arrumar quadros de dados para os serviços da Consulta da Criança Sadia (CCS)
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parse_sisma_smi_cpn()
- Arrumar quadros de dados para os serviços da Consulta Pré-natal (CPN)
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parse_sisma_smi_cpp()
- Arrumar quadros de dados para os serviços da Consulta Pós-parto (CPP)
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parse_sisma_smi_mat()
- Arrumar quadros de dados para os serviços da Maternidade
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parse_sisma_smi_pav()
- Arrumar quadros de dados para os serviços do Programa Alargado de Vacinação (PAV)
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parse_sisma_smi_pf()
- Arrumar quadros de dados para os serviços do Planeamento Familiar (PF)
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parse_sisma_smi_pf_int()
- Arrumar quadros de dados para os serviços do Planeamento Familiar (PF) Integrado
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parse_sisma_smi_ug()
- Arrumar quadros de dados para os serviços de Urgência de Ginecológica
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process_disa_cv()
- Tidy DISA viral load .xlsx files (extracted from OpenLDR)
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process_disa_dpi()
- Tidy DISA DPI .xlsx files (extracted from OpenLDR)
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process_sisma_csv()
superseded - Create tidy dataframes for user-specified SISMA .csv services
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process_sisma_export()
- Arrumar quadros de dados a partir de relatórios padrão SISMA em formato .csv
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read_example_csv()
- função auxiliar que lê dados de exemplo no ambiente R
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seq_vars()
- Reordenar variáveis padrão
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set_language()
- Função auxiliar que define a lingua dos variáveis no quadro gerado
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setup_sismar_folder()
- Cria uma estrutura organizacional (pastas) que é comum a todos os projectos sismar